依據(jù)《建設(shè)項(xiàng)目竣工環(huán)境保護(hù)驗(yàn)收暫行辦法》第六條及第十四條規(guī)定，需要對(duì)建設(shè)項(xiàng)目配套建設(shè)的環(huán)境保護(hù)設(shè)施進(jìn)行調(diào)試的，建設(shè)單位應(yīng)當(dāng)確保調(diào)試期間污染物排放符合國(guó)家和地方有關(guān)污染物排放標(biāo)準(zhǔn)和排污許可等相關(guān)管理規(guī)定。環(huán)境保護(hù)設(shè)施未與主體工程同時(shí)建成的，或者應(yīng)當(dāng)取得排污許可證但未取得的，建設(shè)單位不得對(duì)該建設(shè)項(xiàng)目環(huán)境保護(hù)設(shè)施進(jìn)行調(diào)試。

納入排污許可管理的建設(shè)項(xiàng)目，排污單位應(yīng)當(dāng)在項(xiàng)目產(chǎn)生實(shí)際污染物排放之前，按照國(guó)家排污許可有關(guān)管理規(guī)定要求，申請(qǐng)排污許可證，不得無(wú)證排污或不按證排污。建設(shè)項(xiàng)目驗(yàn)收?qǐng)?bào)告中與污染物排放相關(guān)的主要內(nèi)容應(yīng)當(dāng)納入該項(xiàng)目驗(yàn)收完成當(dāng)年排污許可證執(zhí)行年報(bào)。因此，必須申領(lǐng)排污許可證后方可進(jìn)行調(diào)試、竣工環(huán)保驗(yàn)收監(jiān)測(cè)及自主驗(yàn)收程序。

    關(guān)于環(huán)評(píng)、驗(yàn)收、排污許可、應(yīng)急預(yù)案有關(guān)規(guī)定根據(jù)《中華人民共和國(guó)環(huán)境影響評(píng)價(jià)法》有關(guān)規(guī)定，環(huán)評(píng)應(yīng)在項(xiàng)目開工前完成。根據(jù)《關(guān)于做好環(huán)境影響評(píng)價(jià)制度與排污許可制銜接相關(guān)工作的通知》，環(huán)境影響評(píng)價(jià)制度是建設(shè)項(xiàng)目的環(huán)境準(zhǔn)入門檻，是申請(qǐng)排污許可證的前提和依據(jù)。
根據(jù)《中華人民共和國(guó)環(huán)境保護(hù)法》第四十五條規(guī)定，實(shí)行排污許可管理的企業(yè)事業(yè)單位和其他生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)者應(yīng)當(dāng)按照排污許可證的要求排放污染物；未取得排污許可證的，不得排放污染物。
根據(jù)《控制污染物排放許可制實(shí)施方案》環(huán)境影響評(píng)價(jià)制度是建設(shè)項(xiàng)目的環(huán)境準(zhǔn)入門檻，排污許可制是企事業(yè)單位生產(chǎn)運(yùn)營(yíng)期排污的法律依據(jù)。新建項(xiàng)目必須在發(fā)生實(shí)際排污行為之前申領(lǐng)排污許可證，環(huán)境影響評(píng)價(jià)文件及批復(fù)中與污染物排放相關(guān)的主要內(nèi)容應(yīng)當(dāng)納入排污許可證，其排污許可證執(zhí)行情況應(yīng)作為環(huán)境影響后評(píng)價(jià)的重要依據(jù)。

根據(jù)《企業(yè)事業(yè)單位突發(fā)環(huán)境事件應(yīng)急預(yù)案?jìng)浒腹芾磙k法（試行）》第十七條規(guī)定，建設(shè)單位制定的環(huán)境應(yīng)急預(yù)案或者修訂的企業(yè)環(huán)境應(yīng)急預(yù)案，應(yīng)當(dāng)在建設(shè)項(xiàng)目投入生產(chǎn)或者使用前，按照本辦法第十五條的要求，向建設(shè)項(xiàng)目所在地受理部門備案。

    企業(yè)新建項(xiàng)目在試運(yùn)行階段，可能會(huì)產(chǎn)生實(shí)際的排污行為。根據(jù)相關(guān)法律要求，企業(yè)必須持證排污，不得無(wú)證排污。因此，企業(yè)在投入運(yùn)行并產(chǎn)生實(shí)際的排污行為之前，應(yīng)當(dāng)取得排污許可證。這跟企業(yè)是否通過(guò)環(huán)保驗(yàn)收沒(méi)有必然的關(guān)系。

排污許可證是對(duì)企業(yè)實(shí)際排污行為的許可，根據(jù)《建設(shè)項(xiàng)目環(huán)境保護(hù)管理?xiàng)l例》，試生產(chǎn)行為在竣工驗(yàn)收之前，需要試生產(chǎn)的企業(yè)，不能等到驗(yàn)收之后才申請(qǐng)?jiān)S可證。不僅如此，哪怕企業(yè)連“試生產(chǎn)”都還沒(méi)有正式開始，只是在調(diào)試階段，但只要有實(shí)際的與生產(chǎn)相關(guān)的污染物產(chǎn)生了——即便污染物的類型、排放量跟正常運(yùn)行之后不一樣，企業(yè)都必須在此之前獲得排污許可證。

此外，企業(yè)在申請(qǐng)排污許可證的時(shí)候，竣工驗(yàn)收?qǐng)?bào)告并不是前置條件，但是需要提交環(huán)評(píng)報(bào)告的批復(fù)文件。

因此，環(huán)評(píng)是首位的，而申請(qǐng)排污許可證需要在發(fā)生實(shí)際排污行為之前；而一旦裝置運(yùn)行（試生產(chǎn)、試運(yùn)行）就會(huì)排污，所以排污許可申請(qǐng)需要在環(huán)保驗(yàn)收之前完成，且必須已經(jīng)取得環(huán)評(píng)批復(fù)（或完成登記表備案）。應(yīng)急預(yù)案是投入使用前完成，那么自然是在試運(yùn)行之前。

綜上，可以總結(jié)出以下這個(gè)流程：環(huán)評(píng)編制——取得環(huán)評(píng)批復(fù)（或完成登記表備案）——申請(qǐng)排污許可證——編制環(huán)境風(fēng)險(xiǎn)應(yīng)急預(yù)案——試運(yùn)行——開展竣工環(huán)保驗(yàn)收——完成自主驗(yàn)收——正式投產(chǎn)。